[바이오 정보 퀵서비스] #3 유용한 데이터베이스 사이트 추천 -바이오 정보 천사 조아란-

안녕하세요 반갑습니다 ! K-Biox 홈페이지 관리 및 뉴스작성 등을 맡고 있는 조아란입니다.

정보 퀵서비스 뉴스에서는 빠르게 도움이 될만한 정보들, 또 즐겁게 구경할 수 있는 정보나 읽을거리들을 퀵서비스처럼 배달해드리는 뉴스를 제공하고 있습니다.

 

오늘은 연구에 도움이 될 수 있는 데이터베이스 사이트를 몇가지 소개해드리려 합니다 !

논문 정보들을 구축한 데이터베이스를 잘 활용하면 유용한 정보를 쉽게 찾을 수 있는데요, 그러면 한번 보러 가실까요 ?

 

 

1. TRRUST version 2

 

https://www.grnpedia.org/trrust/

 

 

TRRUST는 전사조절 네트워크 데이터베이스로, 인간과 흰쥐의 전사인자 (Transcription factors, TFs)들과 그들의 조절 대상 유전자들의 관계를 문헌에서 수집해 구축한 데이터베이스입니다.

 

 

전사조절관계를 다룬 논문 정보 하나하나를 수집해 구축한 데이터베이스이고, regulator gene에 관한 TF를 찾거나 protein-protein interaction 등을 확인할 수 있습니다.

 

2. HumanNet v3

 

https://staging2.inetbio.org/humannetv3/

 

 

humannet은 human disease gene에 관련된 데이터베이스로, 유전자에 관한 정보를 얻을 수 있는 데이터베이스입니다.

 

 

humannet은 검색하는 gene과 상관있는 gene 들을 찾아주고 그 사이의 관련성이나 interection에 대한 정보를 제공합니다.

human disease와 관련있는 gene을 검색하면 이렇게 관련있는 gene들이 나오고, 이 gene에 관련된 핵심 키워드나 매커니즘 등을 검색할 수 있습니다.

 

 

3. PDBe-KB

 

https://www.ebi.ac.uk/pdbe/pdbe-kb/

 

 

protein에 대한 database 입니다. 원하는 protein 이름을 검색창에 검색하면 protein에 관련된 정보들을 얻으실 수 있습니다.

 

 

특별히 웹브라우저 내에서 3D view를 살펴보실 수 있고 expression system이나 FASTA sequence등의 정보를 확인할 수 있습니다.

또한 관련 protein과 interecting 하는 compound에 대한 화학식과 화학구조를 확인할 수 있어 매커니즘을 규명하는 연구를 진행하거나 그랜트를 작성할 때 도움을 많이 받을 수 있습니다.

 

 

[참고 문헌 및 사이트]

https://www.ibric.org/bric/hanbitsa/han-interview.do?mode=view&id=51549&authorId=28288#!/list

 

정보 퀵서비스 뉴스에서는 뉴스를 통해 빠르게 도움이 될만한 정보들을 퀵서비스처럼 배달해드리고 있습니다.

앞으로도 지속적으로 많은 관심 부탁드립니다 !

 

편집 : 조아란

 

Netbook 2024
프리미엄 후원사
인재풀 등록 QR코드
골드 후원사
기부의 전당