[오늘의 논문 보석 – 1] 8월 31일자 논문 보석 💎 – 논문 천사 신채림 –

[오늘의 논문 보석] 9월 2일자 논문 보석 💎 – 논문 천사 왕순홍 –

⚠️오늘 발굴된 보석들을 확인하시겠습니까?⚠️

 

안녕하세요 오늘 발견된 귀중한 논문 보석들을 소개하는 K-BioX 기자단 신채림입니다

무궁무진하게 넓은 인터넷 바닷속에는 보석같은 논문들이 여기저기 숨겨져 있는데요  

이 보석같은 논문들을 하나하나씩 발굴하는 논문 천사들의 오늘의 보석을 소개합니다 💎 

 

1. Quantum algorithms for quantum dynamics

Miessen, A., Ollitrault, P.J., Tacchino, F. et al. Quantum algorithms for quantum dynamics. Nat Comput Sci 3, 25–37 (2023).https://doi.org/10.1038/s43588-022-00374-2

 

다양한 학문 분야에서 마주치는 다양한 계산적 어려움 가운데 양자 역학 시스템은 가장 어려운 과제 중 하나로, 양자 기술 분야의 성장에 자연스러운 연구 분야를 제공합니다. 이 관점에서 양자 동역학을 위한 양자 알고리즘 솔루션을 논하며 최신 동향을 보고 잠재력과 현재 제한 사항에 대한 견해를 제시합니다. 또한 앞으로 몇 년 동안의 연구 방향과 유망한 응용 분야를 소개합니다.

 

보석 발굴가: 권경표 님

2. Hypothalamic GABRA5-positive neurons control obesity via astrocytic GABA

Sa, M., Yoo, ES., Koh, W. et al. Hypothalamic GABRA5-positive neurons control obesity via astrocytic GABA. Nat Metab (2023). https://doi.org/10.1038/s42255-023-00877-w

연구에서는 라틴 하이포달라믹 지역(LHA)의 GABRA5 양성 뉴런(GABRA5LHA)이 지방 조절에 관여하는 것을 밝혔습니다. GABRA5LHA는 지방 조직으로 신경을 보내며, 비만 마우스 모델에서 식이 유발성 비만에서 남성에서의 발화 속도가 감소하는 것을 관찰하였습니다. GABRA5LHA의 활성 억제는 지방 열생성을 억제하고 체중 증가를 촉진하며, LHA의 GABRA5 유전자 침묵은 체중 증가를 감소시킵니다. 아스트로사이트에서의 GABA 생성을 억제하는 것이 비만 치료의 분자적 대상 중 하나일 수 있다는 제안을 하였습니다.

보석 발굴가: 송용준 

 

3. Preferred microenvironments of halogen bonds and hydrogen bonds revealed using statistics and QM/MM calculation studies

Zhou, L., Li, J., Shi, Y., Wu, L., Zhu, W., & Xu, Z. (2023). Preferred microenvironments of halogen bonds and hydrogen bonds revealed using statistics and QM/MM calculation studies. Physical Chemistry Chemical Physics, 25(26), 17692-17699. https://doi.org/10.1039/d3cp02096g

이 연구는 수소결합(HBs)과 할로겐결합(XBs)이 단백질 미세환경에 영향을 받는 방식을 조사한 것으로, XBs가 HBs보다 소수성 미세환경을 더 선호한다는 결과를 보여줍니다. 아미노산 유형에 따라서도 차이가 있으며, 이러한 상호작용은 미세환경에 따라 강도가 변화한다는 것을 보여줍니다.

보석 발굴가: 권경표

4. Intratumoral Immune Triads are Required For Adoptive T Cell Therapy-Mediated Elimination of Solid Tumors

Espinosa-Carrasco, G., Scrivo, A., Zumbo, P., Dave, A., Betel, D., Hellmann, M., Burt, B., Lee, H., & Schietinger, A. (2023). Intratumoral immune triads are required for adoptive T cell therapy-mediated elimination of solid tumors. https://doi.org/10.2139/ssrn.4510520

 

이 연구에서는 암 환자의 CD8 T 세포 기능 부전을 극복하기 위해 CD4 T 세포를 활용하는 방법을 연구했습니다. CD8 및 CD4 T 세포와 항원 제시 세포 간의 상호작용이 항암 효과에 중요하며, 이를 통해 큰 종양의 제거와 재발 방지가 가능함을 발견했습니다. 이 결과는 암 면역 치료 분야에서 중요한 역할을 합니다.

 

보석 발굴가: 안태영 

5. Integrated Genomic and Clinicopathologic Approach Distinguishes Pancreatic Grade 3 Neuroendocrine Tumor From Neuroendocrine Carcinoma and Identifies a Subset With Molecular Overlap

Umetsu, S. E., Kakar, S., Basturk, O., Kim, G. E., Chatterjee, D., Wen, K. W., Hale, G., Shafizadeh, N., Cho, S., Whitman, J., Gill, R. M., Jones, K. D., Navale, P., Bergsland, E., Klimstra, D., & Joseph, N. M. (2023). Integrated Genomic and Clinicopathologic approach distinguishes pancreatic grade 3 neuroendocrine tumor from neuroendocrine carcinoma and identifies a subset with molecular overlap. Modern Pathology, 36(3), 100065. https://doi.org/10.1016/j.modpat.2022.100065

이 연구에서는 췌장 신경내분비 종양의 정확한 분류를 위해 분자 프로파일링과 면역조직화학 검사를 결합하여 진단 정확도를 크게 향상시켰으며, PanNET과 PanNEC 사이에 중첩된 특징을 가진 드문 케이스를 식별했습니다.

보석 발굴가: 박병준

6. β-NGF and β-NGF receptor upregulation in blood and synovial fluid in osteoarthritis

Montagnoli, C., Tiribuzi, R., Crispoltoni, L., Pistilli, A., Stabile, A. M., Manfreda, F., Placella, G., Rende, M., & Cerulli, G. G. (2017). β-NGF and β-NGF receptor upregulation in blood and synovial fluid in osteoarthritis. Biological Chemistry, 398(9), 1045-1054. https://doi.org/10.1515/hsz-2016-0280

 

이 연구는 무릎 골관절염(OA) 환자의 혈청 및 관절액에서 β-NGF와 그 수용체 TrKA 및 p75NTR의 양 및 발현 수준을 조사하여 질병 단계와의 가능한 상관 관계를 확인하기 위한 것이었습니다. 결과는 OA 환자에서 β-NGF 및 그 수용체의 양이 진행된 단계와 관련이 있음을 보여주며, 염증성 단핵구의 증가와 함께 OA 환자에서 더 높은 수준의 β-NGF, TrKA 및 p75NTR 발현을 나타냅니다. 이로써 OA의 염증 과정에서 β-NGF 및 그 수용체가 단계별로 변화한다는 가능성을 제시합니다.

 

보석 발굴가: 쏭

7. Electro-metabolic coupling in multi-chambered vascularized human cardiac organoids

Ghosheh, M., Ehrlich, A., Ioannidis, K., Ayyash, M., Goldfracht, I., Cohen, M., Fischer, A., Mintz, Y., Gepstein, L., & Nahmias, Y. (2023). Electro-metabolic coupling in multi-chambered vascularized human cardiac organoids. Nature Biomedical Engineering. https://doi.org/10.1038/s41551-023-01071-9

이 연구에서는 인간과 작은 동물 모델 간의 생리학적 차이로 인한 심장 생리학 연구의 어려움을 극복하기 위해 자발적으로 형성된 다실린 자발적 혈관화된 인간 심장 오르가노이드를 개발했습니다. 이 미세 생리학적 시스템은 산소 흡수, 세포 외 필드 전위 및 심장 수축을 동시에 고분해능으로 측정하는 센서를 포함하고 있으며, 심장 리듬과 미토콘드리아 역학 연구에 도움을 주고 인간 심장 생리학의 이해를 더욱 발전시킬 수 있음을 보여줍니다.

보석 발굴가: Grace

8. Chemical reprogramming takes the fast lane

Park, E. J., Kodali, S., & Di Stefano, B. (2023). Chemical reprogramming takes the fast lane. Cell Stem Cell, 30(4), 335-337. https://doi.org/10.1016/j.stem.2023.03.001

작은 분자 유도 세포 운명 전환은 효율성이 낮고 속도가 느리다는 특징을 가지고 있습니다. 최적화된 화학 프로그래밍 접근 방식은 체세포를 다능성 줄기세포로 빠르고 견고하게 전환할 수 있게 해주어, 인간 세포 정체성을 연구하고 조작하는 흥미로운 가능성을 열어줍니다.

보석 발굴가: 김현규

9. Early Life Reprogramming-Based Treatment Promotes Longevity

Pessina, P., & Di Stefano, B. (2023). Early life reprogramming-based treatment promotes longevity. Cellular Reprogramming, 25(1), 9-10. https://doi.org/10.1089/cell.2022.0153

 

체세포 리프로그래밍 기술은 후성유전적 초기화를 통해 전분화능 줄기세포주를 확립합니다. 이 기술이 최근 후성유전적 침식에 의해 유발되는 노화를 되돌릴 수 있다고 합니다.

 

보석 발굴가: 김현규

10. Cell identity and plasticity uncoupled

Di Stefano, B. Cell identity and plasticity uncoupled. Nat Cell Biol 24, 1326–1327 (2022). https://doi.org/10.1038/s41556-022-00943-7

 

세포 정체성의 기전은 여전히 잘 이해되지 않고 있습니다. 최근의 연구에서는 악성 변화나 다능성으로 다시 프로그래밍되는 단일 세포의 전사적 경로를 분석하고, 이러한 생물학적 과정에서 세포 가용성을 조절하는 조절자들을 밝혀냅니다.

보석 발굴가: 김현규

11.Industry Perspective on the Pharmacokinetic and Absorption, Distribution, Metabolism, and Excretion Characterization of Heterobifunctional Protein Degraders

Volak, L. P., Duevel, H. M., Humphreys, S., Nettleton, D., Phipps, C., Pike, A., Rynn, C., Scott-Stevens, P., Zhang, D., & Zientek, M. (2023). Industry perspective on the pharmacokinetic and absorption, distribution, metabolism, and excretion characterization of Heterobifunctional protein degraders. Drug Metabolism and Disposition, 51(7), 792-803. https://doi.org/10.1124/dmd.122.001154

 

이 연구는 대상 단백질 분해제 (TPD)에 대한 조사 결과를 다룹니다. TPD는 경구용 이용 가능성을 위한 물리화학적 특성이 다르지만 기본적으로 다른 bRo5 화합물과 큰 차이가 없으며, 일부 수정이 필요한 것으로 나타났습니다. PK/ADME 평가를 위한 일반적인 워크플로우도 제안되었습니다.

전반적으로, 제약산업계에서 protac의 adme에 대해 어떻게 보고 있는지를 의견을 모아놓은 글입니다. 

보석 발굴가: hogune

위 논문들은 ‘K-BioX Biomedical 저널 디스커션 포럼’ 카톡 오픈채팅방에서 논의되고  있습니다. 

더 많은 논문 디스커션을 원하신다면 https://open.kakao.com/o/gBQ0CWTd

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편집: 신채림 

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